1956年我院在国内肿瘤医院中首先建立中医门诊，1964年成立上海市卫生局所属上海市肿瘤研究所中医中药研究室，为国内最早成立的专业中医药肿瘤研究室。1979年由上海市卫生局更名为上海市肿瘤医院中医科和中西医结合肿瘤研究室，同年部属、部批，名称同上。现有教授4名，副教授6名，主治医师5名，住院医师2名（在读博士2名，硕士4名）。床位60张。采用的中西医结合治疗方法主要有介入治疗、高强度聚焦超声治疗（HIFU）、射频治疗、放射治疗、中医药治疗、针灸治疗、生物治疗等。近3年平均每年收治住院病人约1000人/次。学科主要从事各种肿瘤的中西医结合治疗，以及相关新药物的研发。其中，门诊是以中医中药治疗各种肿瘤为主，部分病人作为放疗、化疗的辅助治疗和减轻毒副反应的治疗。专病门诊主要是针对中晚期肝癌和胰腺癌的中西医综合治疗。我科研制的特色制剂有免疫冲剂、肺病冲剂、消瘤I号胶囊等十几种，其中专病的特色制剂有熊胆消瘤胶囊、肝97Ⅰ冲剂、肝病冲剂等达四种以上。从80年代到现在，科室已培养博士15名，硕士23名。已经毕业的硕士、博士研究生，在国内外各自的岗位上作出了突出的成绩。科室首任主任于尔辛教授为我院荣誉教授，擅长各种肿瘤的中西医结合治疗，曾任中国中西医结合研究会肿瘤专业委员会副主任委员，上海市中西医结合学会常务理事等。是卫生部“全国继承名老中医学术经验”指导老师、上海市名中医、享受国务院特殊津贴。科室以中西医结合肿瘤内科治疗为主，重点肝、胆、胰腺癌。尤其是肝癌和胰腺癌疗效尤为突出。自60年代开始中西医结合诊治原发性肝癌，于尔辛教授采用健脾理气方结合放射、介入等方法治疗原发性肝癌疗效达到国内领先水平，先后多次获得卫生部，国家中医药管理局，上海市科委二、三等奖，2005年被上海市卫生局授予上海市中西医结合肝癌特色专科。刘鲁明教授在继承于尔辛教授肝癌治疗的基础上又开展了以清胰化积中药为主配合放、化疗及HIFU治疗中晚期胰腺癌，并取得显著的临床疗效，疗效达到国际先进水平，受到同行专家和病人的广泛好评。2010年中西医结合胰腺癌研究通过上海市卫生局验收，被授予上海市中西医结合胰腺癌优势专科称号。2011年被卫生部授予国家中西医结合肿瘤临床重点专科。